定量荧光显微镜利用荧光的强度来得到局部细胞浓度的信息，而这些细胞是由荧光探针标记的。荧光探针具有一定的物理性质，他们的激发和辐射曲线有一定的特点。而激发荧光会使探针材料发生“漂白”作用造成损坏。而荧光探针的另外一种特性是荧光寿命特性，荧光寿命是指激发停止后的辐射时间，通常这一时间为几个纳秒。通过对荧光寿命进行s显微成像可以获得从一个荧光探针到另外一个探针的荧光共振转移能量。荧光寿命显微成像技术有更多的应用，它可以辨别不同染料发出的荧光，有些不同染料会显示相同的吸收与辐射特性但是具有不同的荧光寿命特征。荧光寿命显微成像技术通过荧光寿命探知荧光探针的空间分布，而不是依靠荧光强度不同辨别，不会产生“漂白”效应。

    LIFA系统由频率来控制。这种方式需要有一个调制的光源和调制的探测器。利用正弦调制光源作为激发光源。荧光强度显示了由于激发和调制深度而产生的相移。相位移动和调制深度随荧光材料荧光寿命和调制频率而变化。为了得到相位移动和调制深度，我们应用了像增强器和摄像机耦合(ICCD)技术。像增强器的信号灵敏度以相同的频率进行调制作为激发调制光源，但是要加入可调整的相位移动。对于像增强器的灵敏度调制影响荧光信号的相位移动，而输出信号的大小取决于这个相位移动大小。一系列的相位移动最终产生一系列的测量结果。

    像增强器和摄像机进行耦合成为一个探测器。对像增强器的增益进行调制。通过电脑对摄像机和像增强器进行控制。不同波长的LED灯可以固定在显微镜的弧形灯座上，作为激发调制光源。可以应用不同的激光二极管(LD)，通过对连续的激光光源进行调制得到所需要的输出。

    LED和像增强器都连接在FLIM信号发生器上进行调制，由电脑来控制二者的频率和放大倍数已经相位移动。

    LI-FLIM软件可以控制像增强器，摄像机，光源以及信号发生器的设定，计算每一个像元的寿命，并且显示一维和二维的数据。用统一标准分析合成每一个像元的强度，相位和调制程度的结果。每一个像元的荧光寿命可以通过把鼠标移动到数据条上获得。